基槽和土工膜防滲渠道鋪膜的斷面通常有梯形、階梯形、鋸齒形、矩形四種，其中梯形斷面最為常見，它具有斷面小、省工省料、操作方便的優點，同時也存在邊坡穩定性低的缺點。階梯形和鋸齒形斷面的邊坡系數為m1=m2，具有抗滑穩定性好的優點。缺點是土方量大，勞動力多，膜料消耗多。矩形截面的優點是防穿筘效果好，穩定性好。缺點是土方量大，用料多，比較適合穿筘和較小的渠道。

土工膜防滲渠道應埋設，其結構可分為過渡層和無過渡層兩種。在巖石和礫石河道上鋪膜時，應設置過渡層。土渠鋪膜一般不設過渡層，但當堤內地下水位高且有內部水壓時，應設排水層降低地下水位，以免頂起膜，破壞渠坡。

渠道的橫截面尺寸應通過水力計算確定。設計中考慮的因素包括:設計流量、渠道縱坡、渠道堤高、坡度系數、允許流速、渠床土質和基本斷面類型等。

薄膜防滲渠道保護層損壞的原因之一是渠道沖刷。保護層破壞后，薄膜暴露，容易損壞，失去防滲能力。為了避免這種情況，通道速度應限制在允許的范圍內。